コピー先のファイルを開く時、ダイアログボックスを利用する方法があります。
↓のサイトをご覧ください。
名前を指定してブックを開く
http://officetanaka.net/excel/vba/file/file02.htm

または、ファイルが決まっていて、変化しないのなら、
ユーザーフォームを作って、オプションボタンで選択する仕組みも考えられます。